厦门ISO14001环境管理体系的申请流程通常包括以下步骤：

提交申请：向所选的认证机构提交ISO 14001认证申请。在申请中，您需要提供组织信息、活动范围以及所需的认证范围等。

初步评估（可选）：一些认证机构可能会进行初步评估，以评估您的组织是否准备好进行正式的认证审核。这一步骤通常是可选的，取决于认证机构的要求。

准备文件和记录：您需要准备ISO 14001认证所需的文件和记录，包括环境政策、目标、程序、文件、纪录等。这些文件应详细记录您的组织如何满足ISO 14001标准的要求。

文件审核：认证机构将对您的环境管理体系文件进行审核，以确保其符合ISO 14001标准的要求。如果文件审核通过，将进入现场审核阶段。

现场审核（阶段1）：认证机构将进行现场审核，通常分为两个阶段。阶段1的审核侧重于评估组织的环境管理体系，确保其已经建立并与标准要求一致。如果在审核中发现问题，您的组织需要采取纠正措施来解决这些问题。

纠正措施：如果在阶段1的审核中发现问题，您需要采取适当的纠正措施，并在规定的时间内完成。这些纠正措施应确保您的环境管理体系符合ISO 14001标准的要求。

现场审核（阶段2）：阶段2的审核侧重于评估环境管理体系的实际运作，包括环境方面的风险管理、绩效改进等。认证机构将检查您的组织是否按照环境管理体系的要求进行了操作，并检查环境绩效的改进情况。

颁发证书：如果阶段2的审核通过，认证机构将颁发ISO 14001认证证书，证明您的组织已经建立了符合ISO 14001标准要求的环境管理体系。

此外，在认证过程中，您可能需要提供以下文件或资料：

营业执照

环境影响评价报告

“三同时”验收报告（如果适用）

排污许可证（如果适用）

危险废弃物处理合同及转移联单（如果适用）

环境因素清单、重大环境因素清单

目标指标管理方案及监控记录

适用环境法律法规及其他要求清单

请注意，以上流程可能因认证机构和企业的实际情况而有所不同。在申请前，建议详细咨询认证机构或专业顾问，以确保了解详细的申请流程和要求。